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動(dòng)植物基因組de novo測序

基因組從頭測序(de novo sequencing),主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種,構(gòu)建不同類型的基因組DNA文庫,并進(jìn)行序列測定。

遺傳變異檢測

利用高通量測序技術(shù)對某一物種或群體的基因組進(jìn)行測序,通過與參考基因組進(jìn)行比較,獲得該物種或群體在全基因組范圍內(nèi)的遺傳變異信息(SNP、InDel、SV、CNV)等,建立遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)庫,為后續(xù)揭示進(jìn)化關(guān)系、功能基因挖掘等研究奠定基礎(chǔ)。

BSA性狀定位

BSA(Bulked Segregant Analysis):稱為混合分組分析法,是一種利用極端性狀進(jìn)行功能基因定位的一種方法。

遺傳圖譜構(gòu)建

遺傳圖譜(Genetic map)又稱遺傳連鎖圖譜(Genetic linkage map),是分子標(biāo)記在染色體上的排列順序與相對距離的線形圖。

群體進(jìn)化

利用全基因組重測序或簡化基因組測序(dd-RAD)技術(shù)獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息,通過與參考基因組比對或聚類分析的方法得到大量變異信息,基于SN P信息討論群體的遺傳結(jié)構(gòu)、基因交流情況、物種形成機(jī)制以及群體進(jìn)化動(dòng)態(tài)等生物學(xué)問題。

全基因組關(guān)聯(lián)分析

全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWAS)是一種在某一特定群體中研究遺傳突變和表型之間的相關(guān)性的方法。

SSR分子標(biāo)記開發(fā)

微衛(wèi)星 (Microsatellite) 又稱小串聯(lián)重復(fù) (Short Tandem Repeats, STRs)(Simple Sequence Repeats, SSR)。在各種真核生物基因組中,分布廣且比較均勻。