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菌群多樣性組成譜測序

菌群多樣性組成譜測序以細菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S rRNA 基因可變區或真菌 ITS（Internaltranscribed spacer）內轉錄間隔區等微生物特征序列（Signature sequence）為靶點(diǎn)......

標記基因全長(cháng)測序

以PacBio公司的RS II和最新的Sequel測序系統為代表的第三代測序技術(shù)，通過(guò)SMRT單分子實(shí)時(shí)測序技術(shù)（Single molecule real-time sequencing），可以對DNA序列實(shí)現單分子級別的超長(cháng)讀長(cháng)測序，因而能夠輕易讀取微生物的rRNA基因/ITS全長(cháng)序列，不再受制于短序列的局限性，更全面的揭示物種多樣性

擴增子/功能基因測序

借助合適的類(lèi)群特異性引物，可以檢測菌群中特定種類(lèi) / 功能微生物的特征序列，反映菌群中該特定類(lèi)群微生物的組成結構，從而發(fā)現它們的分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而揭示該類(lèi)群微生物中與差異相關(guān)聯(lián)的關(guān)鍵成員。

宏轉錄組測序

宏轉錄組學(xué)（Metatranscriptomics）的研究對象是微生物組mRNA，在獲取微生物組總RNA并去除rRNA之后，反轉錄為cDNA，并構建合適長(cháng)度的插入片段文庫，對這些文庫進(jìn)行雙端（Paired-end，PE）高通量測序，從而能精確定量整個(gè)菌群中具有活性的物種精細組成及其對應功能的表達水平，進(jìn)而鎖定菌群中的關(guān)鍵生物標記物、闡明其生物學(xué)意義。

宏基因組測序

宏基因組學(xué) (Metagenomics) 研究通過(guò)全基因組鳥(niǎo)槍法 (Whole Genome Shotgun， WGS) 測序策略，將提取獲得的微生物組總 DNA 隨機打斷為短片段，并構建合適長(cháng)度的插入片段文庫，對這些文庫進(jìn)行雙端 (Paired-end， PE) 高通量測序，從而能全面精細地展示整個(gè)菌群的功能代謝譜和物種精細組成譜，進(jìn)而在組成和功能水平分別挖掘關(guān)鍵生物標記物，從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統中發(fā)揮作用的根本機制。
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