菌群多樣性組成譜測序

菌群多樣性組成譜測序研究

菌群多樣性組成譜測序以細菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S rRNA 基因可變區或真菌 ITS（Internaltranscribed spacer）內轉錄間隔區等微生物特征序列（Signature sequence）為靶點(diǎn)，通過(guò)檢測序列的變異和數量，反映菌群中各類(lèi)微生物物種的身份和豐度，從而快速解碼菌群物種分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而發(fā)現差異相關(guān)物種。

產(chǎn)品特點(diǎn)

1. 直接對菌群樣本中的微生物特征序列進(jìn)行擴增檢測，簡(jiǎn)單快速且性?xún)r(jià)比高，并克服了絕大部分微生物無(wú)法純培養的難題；

2. 自動(dòng)化、專(zhuān)業(yè)的DNA提取流程，配合高保真DNA聚合酶進(jìn)行PCR擴增，并嚴格把控擴增循環(huán)數，確保菌群組成客觀(guān)真實(shí)；

3. 使用Illumina MiSeq的小型化測序平臺，周期更短，讀長(cháng)更長(cháng)（2′300 bp），每個(gè)樣本都能一次性獲得數萬(wàn)條序列，即使低豐度物種也能精確定量；

4. 多種物種注釋數據庫可選，根據樣本來(lái)源按需選擇Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等數據庫，優(yōu)化物種的分類(lèi)鑒定；

5. 可對菌群進(jìn)行代謝功能預測，通過(guò)組成數據，解讀潛在功能，并能指導后續宏基因組測序研究。

實(shí)驗流程

微生物組總DNA提取→目標片段PCR擴增→擴增產(chǎn)物檢測定量→測序文庫制備→上機進(jìn)行高通量測序