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10× Genomics Visium空間轉錄組

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10× Genomics Visium空間轉錄組

10× Genomics Visium空間轉錄組基于組織學(xué)目的對新鮮冷凍組織切片進(jìn)行成像，并將切片放置在含有與RNA結合的捕獲探針的陣列上，結合高通量測序技術(shù)，揭示空間范圍內的轉錄組信息，為科研工作者提供最為精確、全面的轉錄譜信息。是腫瘤細胞異質(zhì)性、免疫細胞群體檢測以及胚胎發(fā)育研究的黃金方法。

1、樣本要求：哪些樣本可以進(jìn)行空間轉錄組測序？

10x官方已測試的樣本類(lèi)型可以參考官網(wǎng)：

https://support.10xgenomics.com/spatial-gene-expression/tissue-optimization/doc/specifications-visium-spatial-gene-expression-optimized-tissues

2、樣本處理：

a. 樣本截面大小應不超過(guò) 6.5mm X 6.5mm。如果樣本過(guò)?。?lt;3mm），可在冷凍包埋時(shí)將多個(gè)樣本同時(shí)進(jìn)行；

b.先冷凍后OCT包埋法或者OCT包埋和冷凍同時(shí)進(jìn)行法；