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真菌基因組de novo測序

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真菌基因組de novo測序

真菌全基因組從頭測序（Fungi Whole Genome de novo Sequencing），是指對基因組序列未知或無(wú)近緣物種基因組信息的某個(gè)物種，構建不同插入片段的基因組DNA文庫并對文庫進(jìn)行序列測定，然后利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行拼接、組裝和注釋?zhuān)瑥亩@得該真菌的全基因組序列圖譜。



產(chǎn)品參數

1、簡(jiǎn)單真菌：35% ≤ G+C% ≤ 65% 且雜合度 ≤ 0.5%且基因組 ≤ 40 Mb； 

2、復雜真菌：G+C% > 65% 或 G+C% > 35%或雜合度 > 0.5%或基因組 > 40 Mb； 

   Contig N50：將組裝得到的 Contig  按序列長(cháng)度從長(cháng)到短排序并依次累加，當累加長(cháng)度正好達到序列總長(cháng)度  50%  時(shí)，最后一條序列的長(cháng)度。



上一個(gè)： 真菌基因組重測序
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