細菌全基因組完成圖測序
細菌完成圖測序是指對基因組序列未知或無(wú)近緣物種基因組信息的某個(gè)物種,構建不同插入片段的基因組文庫,基于 PacBio第三代單分子測序技術(shù)結合第二代高通量測序技術(shù),對這些文庫進(jìn)行序列測定,利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行拼接,獲得完整的染色體及質(zhì)粒序列,解析編碼信息和表觀(guān)遺傳修飾信息。
應用領(lǐng)域
l 獲得完整的染色體序列圖譜
l 獲得完整的質(zhì)?;?BAC 克隆子序列圖譜
l 解析甲基化修飾相關(guān)信息(6mA和4mC)
派森諾優(yōu)勢
(1) 項目周期短:完成圖最短項目周期 15 工作日,平均項目周期 30 工作日;
(2) 方案設計合理:完成圖的方案以三代平臺為主、二代平臺為輔,得到完整的染色體和質(zhì)粒序列圖譜;
(3) 免費贈送待測菌株的菌種鑒定,以防菌株錯測;
(4) 拼接結果準確:三輪校正(拼接前利用三代測序數據間的 Overlap 對測序數據進(jìn)行校正;拼接后,利用三代測序數據對拼接結果進(jìn)行第二輪校正;最后,利用高質(zhì)量的二代測序數據對拼接結果進(jìn)行多次校正)使得到的基因組拼接結果更加準確、可靠;
(5) 項目經(jīng)驗豐富:細菌完成圖已完成樣品數量近 300 例;
(6) 細節服務(wù)到位:無(wú)論是圈圖起始位點(diǎn)的調整,還是起始密碼子的翻譯(所有起始密碼子的氨基酸均為甲硫氨酸),力求做到滿(mǎn)意。