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SNP位點(diǎn)篩查

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SNP位點(diǎn)篩查

一、SNPs篩查和鑒定簡(jiǎn)介

單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),即指由于單個(gè)核苷酸堿基的改變而導致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個(gè)體的同一條染色體或同一位點(diǎn)的核苷酸序列中,絕大多數核苷酸序列一致而只有一個(gè)堿基不同的現象,這就是SNP。

SNPs所表現的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異。一般來(lái)說(shuō),一個(gè)SNPs位點(diǎn)只有兩種等位的基因,因此又叫雙等位基因。單核苷酸多態(tài)性包括單個(gè)堿基的缺失和插入,更多情況是單個(gè)堿基的置換。通常情況下是一種二等位基因的變異,多為轉換,即一種嘧啶堿基換為另一種嘧啶堿基,或一種嘌呤堿基換為另一種嘌呤堿基,轉換與顛換之比為21。SNPCG序列上出現最為頻繁,而且多是C→T,因為CGC即胞嘧啶常為甲基化的,自發(fā)脫氨后即變?yōu)樾叵汆奏ぁ?/span>SNP的分布不均勻,非轉錄序列中要多于轉錄序列,絕大多數位于蛋白的非編碼區。

為適應廣大用戶(hù)日益增長(cháng)的SNPs研究需求,我公司推出全方位的SNPs篩查和鑒定服務(wù),利用以下技術(shù)方案為不同客戶(hù)量身定做個(gè)性化的服務(wù)。


 二、收費標準

具體費用請來(lái)點(diǎn)詢(xún)問(wèn)。我們會(huì )在最具競爭性的價(jià)格條件下提供高精度,高通量的SNPs篩查和檢測服務(wù)。 


 三、特別說(shuō)明

關(guān)于樣本質(zhì)量:在對SNP標記進(jìn)行基因掃描時(shí),經(jīng)常會(huì )出現某些樣本的某些位點(diǎn)無(wú)法檢出,這通常與樣本DNA 的質(zhì)量有關(guān),可以通過(guò)提高樣本 DNA 的質(zhì)量來(lái)避免,但盡管如此,對于每一個(gè)樣本,尤其是進(jìn)行大量位點(diǎn)全基因組掃描的樣本,仍會(huì )有一定比例的未檢出現象存在。因此,為了獲得更高的檢出效率,保證樣本 DNA 的質(zhì)量是很關(guān)鍵的。

引物費用

我們推薦的熒光標記有 FAM 、 HEX 、 TAMRA 等,費用請咨詢(xún)我公司。


 四、客戶(hù)須知

1、客戶(hù)盡量保證同一引物的每個(gè)模板擴增效率基本一致,我們將每對引物每96孔板隨機抽取3個(gè)樣品進(jìn)行預實(shí)驗以確定上樣量,如果客戶(hù)樣品擴增效率低或擴增效率不一致導致某些樣品未檢出信號,我公司仍收取檢測費用;

2、為了保證進(jìn)度,本公司采用批量上樣的方法,如果預檢測未發(fā)現異常,而實(shí)際檢測后發(fā)現異常:如大量樣本未擴出或擴增效率低等情況我們會(huì )及時(shí)通知客戶(hù),由客戶(hù)決定是否繼續檢測,之前產(chǎn)生的檢測費用由客戶(hù)承擔,請客戶(hù)保證樣本質(zhì)量;

3、客戶(hù)如果采用一個(gè)泳道內放入多個(gè)同種標記位點(diǎn),請一定確認這些位點(diǎn)的擴增產(chǎn)物大小范圍不重疊,以免檢測結果無(wú)法判讀。我們在檢測過(guò)程中發(fā)現問(wèn)題會(huì )及時(shí)通知客戶(hù),已往檢測費用由客戶(hù)承擔??蛻?hù)如果不知道是否重疊,可以先行提供部分樣本分別檢測各個(gè)位點(diǎn),根據我們的實(shí)驗結果來(lái)確定,檢測費用由客戶(hù)承擔;

4、根據客戶(hù)提供的信息,軟件將自動(dòng)判讀結果,為保證結果的客觀(guān)性,如客戶(hù)要求工作人員進(jìn)行判別,工作人員可以據經(jīng)驗向客戶(hù)提出意見(jiàn),此意見(jiàn)僅供參考,公司不為此承擔任何責任,請客戶(hù)根據自己的實(shí)驗情況判斷每個(gè)峰的取舍;

5、客戶(hù)應保證樣品的密封性。如需樣品返還請提前說(shuō)明,如無(wú)特殊說(shuō)明,一個(gè)月后本公司將處理掉樣本,如客戶(hù)提前未說(shuō)明返還導致樣品丟失本公司不負責任;

6、對客戶(hù)的實(shí)驗結果本公司保留30天,客戶(hù)如有問(wèn)題請在30天內提出,30天后將刪除試驗結果;

7、為了規范服務(wù)流程,避免出現不必要的失誤,即使是長(cháng)期合作項目,客戶(hù)每次送樣必須填寫(xiě)業(yè)務(wù)訂單,謝謝合作,敬請諒解。


 五、SNPs篩查和鑒定的應用領(lǐng)域

由于SNP在人類(lèi)基因組中數量較多,發(fā)生頻率較高,因此被認為是繼微衛星之后的新一代遺傳學(xué)標記,在醫學(xué)遺傳學(xué)、藥物遺傳學(xué)、疾病遺傳學(xué)、疾病診斷學(xué)、以及人類(lèi)進(jìn)化等研究領(lǐng)域都有著(zhù)很高的研究?jì)r(jià)值和應用前景。


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