微衛星 (Microsatellite) 又稱(chēng)小串聯(lián)重復 (Short Tandem Repeats, STRs)(Simple Sequence Repeats, SSR)。在各種真核生物基因組中,分布廣且比較均勻。平均每 6 kb 長(cháng)度中就有 1 個(gè)微衛星位點(diǎn) (Beckmann & Weber, 1992)。但隨著(zhù)每個(gè)重復單位堿基長(cháng)度的增加,微衛星位點(diǎn)的總數減少。具有突變速率快、多態(tài)性高等特點(diǎn)。
SSR 分子標記開(kāi)發(fā)是指對多個(gè)混合樣品的全基因組 DNA 構建基因組文庫,利用探針,采用磁珠富集法富集得到SSR 的核心區域及兩端的保守序列區域,采用第二代高通量測序平臺對文庫進(jìn)行序列測定,利用生物信息學(xué)的分析方法獲得具有多態(tài)性的 SSR 序列并設計引物。
◇ 遺傳圖譜構建 ◇ 種質(zhì)鑒定 ◇ 遺傳多樣性分析 ◇ 基因定位 ◇ 數量性狀基因座(QTL)分析