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真核無(wú)參轉錄組測序

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真核無(wú)參轉錄組測序

產(chǎn)品介紹

指利用高通量測序技術(shù)進(jìn)行cDNA測序，全面快速地獲取某一種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉錄本。目前轉錄組測序產(chǎn)品有真核有參轉錄組測序、真核無(wú)參轉錄組測序和原核轉錄組測序。

技術(shù)線(xiàn)路

福爾馬林固定石蠟包埋。

送樣要求：新鮮FFPE組織切片，厚度不超過(guò)10um（過(guò)厚會(huì )導致RNA得率低），每次用量大約8片，表面積不超過(guò)250mm²。

常溫運輸保存。

分析內容

分析結果展示

圖1 NR注釋統計

圖2 KEGG注釋

圖3 差異表達基因聚類(lèi)

圖4 SNP 和 InDel 統計

常見(jiàn)問(wèn)題

針對無(wú)參考基因組物種的轉錄組測序你們可以提供哪些分析內容？
常規信息分析內容如下：
1、序列拼接及拼裝統計；
2、Unigene功能注釋?zhuān)?/span>
3、Unigene功能聚類(lèi)分析；
4、Unigene的代謝途徑分析；
5、Unigene的表達差異分析（兩個(gè)或者兩個(gè)以上的樣本）；
6、樣品間差異表達Unigene的富集分析（GO、KEGG）；
7、樣品間差異Unigene的表達模式聚類(lèi)分析（3個(gè)樣本及以上）；
8、SNP鑒定；
9、SSR分析。
除了常規信息分析外，還可根據客戶(hù)需求，進(jìn)行可選性信息分析，例如：基因共表達網(wǎng)絡(luò )分析、PCA分析、差異mRNA蛋白互作網(wǎng)絡(luò )分析、轉錄因子分析（適用于植物物種）、樣本特異表達及共有表達基因分析、樣品間相關(guān)性分析、mRNA與miRNA互作分析、mRNA與LncRNA互作分析、DEU分析（適用于有生物學(xué)重復）。

上一個(gè)：真核有參轉錄組測序

下一個(gè)：全長(cháng)轉錄組測序

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電話(huà)：0532-89960003 (測序） 0532-67762873（合成）
郵箱：qingdao@psnbio.com

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