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蛋白質(zhì)定性分析

蛋白質(zhì)全譜分析也可稱(chēng)為質(zhì)譜shotgun分析，指的是組分分析，研究對象是完整的組織、體液或其提取物，其目的在于鑒定出盡可能多的肽和蛋白質(zhì)分子。

靶向蛋白質(zhì)組

PRM（平行反應監視，parallel reaction monitoring）是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監視技術(shù)，能夠對目標蛋白質(zhì)、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進(jìn)行選擇性檢測，從而實(shí)現對目標蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行絕對定量。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾

常規的蛋白質(zhì)組學(xué)研究往往只關(guān)注不同生理、病理條件下蛋白質(zhì)表達水平的變化。

RNA甲基化測序

RNA 甲基化指發(fā)生在RNA 分子上不同位置的甲基化修飾現象，常見(jiàn)的RNA轉錄后修飾方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A) 和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine，m5C)。

全基因組甲基化測序

DNA 甲基化對生命活動(dòng)非常重要，是基因調控的手段之一 ( 即通過(guò)對位于啟動(dòng)子及第一外顯子區的 CpG 島的甲基化而抑制基因的表達 )，它在基因表達調控、腫瘤研究、染色質(zhì)重塑、遺傳印記、疾病研究、胚胎發(fā)育、環(huán)境與表觀(guān)遺傳和表觀(guān)異質(zhì)性等方面起至關(guān)重要的作用，是表觀(guān)遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)。

靶向代謝組

靶向代謝組學(xué)分析主要是以標準品為參照，對特定的代謝物群進(jìn)行有針對性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術(shù)方案包括常規的液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）分析技術(shù)， 以及選擇性反應?/?多反應監測技術(shù)（MRM/ SRM）。

脂質(zhì)代謝組

脂質(zhì)代謝組是一種基于高通量分析技術(shù)，系統性解析生物體脂質(zhì)組成與表達變化的研究模式。脂質(zhì)組學(xué)分析，可以高效地研究脂類(lèi)家族、脂質(zhì)分子在各種生物過(guò)程中的改變與功能，進(jìn)而闡明相關(guān)的生物活動(dòng)機制與原理。

菌群多樣性組成譜測序

菌群多樣性組成譜測序以細菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S rRNA 基因可變區或真菌 ITS（Internaltranscribed spacer）內轉錄間隔區等微生物特征序列（Signature sequence）為靶點(diǎn)......

標記基因全長(cháng)測序

以PacBio公司的RS II和最新的Sequel測序系統為代表的第三代測序技術(shù)，通過(guò)SMRT單分子實(shí)時(shí)測序技術(shù)（Single molecule real-time sequencing），可以對DNA序列實(shí)現單分子級別的超長(cháng)讀長(cháng)測序，因而能夠輕易讀取微生物的rRNA基因/ITS全長(cháng)序列，不再受制于短序列的局限性，更全面的揭示物種多樣性

擴增子/功能基因測序

借助合適的類(lèi)群特異性引物，可以檢測菌群中特定種類(lèi) / 功能微生物的特征序列，反映菌群中該特定類(lèi)群微生物的組成結構，從而發(fā)現它們的分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而揭示該類(lèi)群微生物中與差異相關(guān)聯(lián)的關(guān)鍵成員。

宏轉錄組測序

宏轉錄組學(xué)（Metatranscriptomics）的研究對象是微生物組mRNA，在獲取微生物組總RNA并去除rRNA之后，反轉錄為cDNA，并構建合適長(cháng)度的插入片段文庫，對這些文庫進(jìn)行雙端（Paired-end，PE）高通量測序，從而能精確定量整個(gè)菌群中具有活性的物種精細組成及其對應功能的表達水平，進(jìn)而鎖定菌群中的關(guān)鍵生物標記物、闡明其生物學(xué)意義。

宏基因組測序

宏基因組學(xué) (Metagenomics) 研究通過(guò)全基因組鳥(niǎo)槍法 (Whole Genome Shotgun， WGS) 測序策略，將提取獲得的微生物組總 DNA 隨機打斷為短片段，并構建合適長(cháng)度的插入片段文庫，對這些文庫進(jìn)行雙端 (Paired-end， PE) 高通量測序，從而能全面精細地展示整個(gè)菌群的功能代謝譜和物種精細組成譜，進(jìn)而在組成和功能水平分別挖掘關(guān)鍵生物標記物，從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統中發(fā)揮作用的根本機制。