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細菌基因組de novo測序

細菌全基因組從頭測序（Bacterial Whole Genome de novo Sequencing ），是指對基因組序列未知或無(wú)近緣物種基因組信息的某個(gè)物種，構建不同插入片段的基因組DNA文庫并對文庫進(jìn)行序列測定，然后利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行拼接、組裝和注釋?zhuān)瑥亩@得該細菌的全基因組序列圖譜。

細菌全基因組重測序

細菌全基因組重測序（Bacterial Whole Genome Resequencing），是指對有參考基因組的細菌個(gè)體或群體進(jìn)行高通量測序（待測菌株與參考基因組的序列相似性 ≥ 98%），將測序數據比對至參考基因組上，獲得細菌個(gè)體或群體相對于參考基因組的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列變異信息。

真菌基因組de novo測序

真菌全基因組從頭測序（Fungi Whole Genome de novo Sequencing），是指對基因組序列未知或無(wú)近緣物種基因組信息的某個(gè)物種，構建不同插入片段的基因組DNA文庫并對文庫進(jìn)行序列測定，然后利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行拼接、組裝和注釋?zhuān)瑥亩@得該真菌的全基因組序列圖譜。

真菌基因組重測序

真菌全基因組重測序（Fungi Whole Genome Resequencing），是指對有參考基因組的真菌個(gè)體或群體進(jìn)行高通量測序（待測菌株與參考基因組的序列相似性 ≥ 98%），將測序數據比對至參考基因組上，獲得真菌個(gè)體或群體相對于參考基因組的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列變異信息。

病毒基因組測序

病毒（Virus）由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構成或僅由蛋白質(zhì)構成（如 朊病毒）。根據遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈 DNA 病毒（ssDNA）、雙鏈 DNA 病毒（dsDNA）、單鏈 RNA 病毒（ssRNA）、雙鏈 RNA 病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊病毒）。

線(xiàn)粒體&葉綠體基因組測序

線(xiàn)粒體&葉綠體基因組測序，是指采用利用二代/三代測序平臺，對動(dòng)植物線(xiàn)粒體和植物葉綠體進(jìn)行高通量測序，通過(guò)高深度測序和生物信息分析，獲得線(xiàn)粒體&葉綠體基因組的序列、編碼基因、遺傳進(jìn)化等相關(guān)信息。

質(zhì)粒&BAC克隆子基因組測序

質(zhì)粒 & BAC克隆子的全基因組測序，是指基于第二代高通量測序技術(shù)和/或第三代單分子測序技術(shù)，對質(zhì)?；?BAC 克隆子的全基因組進(jìn)行測序、拼接，利用生物信息分析手段，基于測序深度、GC 含量以及序列比對結果，挑選質(zhì)?；?BAC 克隆子的全基因組序列。

動(dòng)植物基因組de novo測序

基因組從頭測序（de novo sequencing），主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構建不同類(lèi)型的基因組DNA文庫，并進(jìn)行序列測定。

遺傳變異檢測

利用高通量測序技術(shù)對某一物種或群體的基因組進(jìn)行測序，通過(guò)與參考基因組進(jìn)行比較，獲得該物種或群體在全基因組范圍內的遺傳變異信息（SNP、InDel、SV、CNV）等，建立遺傳多態(tài)性數據庫，為后續揭示進(jìn)化關(guān)系、功能基因挖掘等研究奠定基礎。

BSA性狀定位

BSA（Bulked Segregant Analysis）：稱(chēng)為混合分組分析法，是一種利用極端性狀進(jìn)行功能基因定位的一種方法。

遺傳圖譜構建

遺傳圖譜（Genetic map）又稱(chēng)遺傳連鎖圖譜（Genetic linkage map），是分子標記在染色體上的排列順序與相對距離的線(xiàn)形圖。

群體進(jìn)化

利用全基因組重測序或簡(jiǎn)化基因組測序（dd-RAD）技術(shù)獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息，通過(guò)與參考基因組比對或聚類(lèi)分析的方法得到大量變異信息，基于SN P信息討論群體的遺傳結構、基因交流情況、物種形成機制以及群體進(jìn)化動(dòng)態(tài)等生物學(xué)問(wèn)題。